"جمال عرفی" از وزارت کشور ایران در یک کنفرانس خبری تلویزیونی گفت که ۹۰ درصد از ۲۸.۶ میلیون برگ رأی انداخته شده در صندوق‌ها شمارده شده و سید ابراهیم رئیسی با کسب ۱۷.۸ میلیون رای و جلب ۶۲ درصد آراء، رئیس جمهور کشور شده است. پس از رئیسی، آراء باطله با ۱۴ درصد؛ محسن رضایی فرمانده سابق سپاه پاسداران با ۱۱ درصد نفر دوم، عبدالناصر همتی رئیس سابق بانک مرکزی و تنها کاندیدای میانه‌رو با ۸ درصد سوم، و سید امیرحسین قاضی‌زاده هاشمی با ۳ درصد چهارم شدند. پس از این گزارش، روحانی، رئیس جمهور کنونی به رئیسی تبریک گفت.
با مشارکت ۴۸ درصدی، این انتخابات فقط از انتخابات مجلس اسفند ۱۳۹۸ مشارکت بیشتری داشته است. از مدتها پیش از انتخابات گروهی از مخالفان حکومت مانند رضا پهلوی فرزند آخرین پادشاه ایران جنبش "رای نمی‌دهم" را بدلیل محدودیت‌های سیاسی و مشکلات اقتصادی آغاز کرده بودند. در هفته پایانی محمود احمدی‌نژاد رئیس جمهور سابق رد صلاحیت شده، و میرحسین موسوی آخرین نخست وزیر سابق در حصر خانگی نیز اعلان کردند رای نمی‌دهند. سید علی خامنه‌ای رهبر جمهوری اسلامی دو روز پیش از انتخابات از مردم خواسته بود تا حداکثر مشارکت در رای داشته باشند و مردم را به حضور در انتخابات و رای‌گیری در روز جمعه ترغیب کرده بود، اما مخالفان در داخل و خارج از کشور می‌گویند که ناراحتی مردم از مشکلات اقتصادی و آزادی‌ها باعث مشارکت کم شده است.
 
سید ابراهیم رئیسی با ۶۲ درصد آراء، رئیس جمهور ایران شد
رئیسی که یک روحانی ۶۰ ساله است، از پیش از انتخابات انتظار می‌رفت که به ریاست جمهوری برسد زیرا شورای نگهبان بطور وسیعی کاندیداهای رقیب او را "رد صلاحیت" کرده و خامنه‌ای نیز از او حمایت نموده بود. او توسط خامنه‌ای در سال ۲۰۱۹ و پس از شکست از حسن روحانی در انتخابات ریاست جمهوری قبلی، به ریاست قوه قضائیه منصوب شده بود. وی متهم به نقض حقوق بشر در دهه ۶۰ در اعدام هزاران زندانی سیاسی و نیز ناآرامی‌های سال ۸۸ می‌باشد، او تحت تحریم‌های آمریکا نیز هست. ایران هرگز اعدام‌های جمعی را تصدیق نکرده و رئیسی نیز هرگز علناً به ادعاهای مربوط به نقش خود در آنها نپرداخته است. رئیسی در طول مبارزات انتخاباتی خود هیچ برنامه سیاسی یا اقتصادی مفصلی ارائه نداد، اما گفت که از احیای برجام حمایت می‌کند و به جنگ مفاسد اقتصادی خواهد رفت و افزود: "ما در دولت جدید تمام تلاش خود را خواهیم کرد تا مشکل معیشت مردم حل شود". وی در طی مناظره‌های انتخاباتی متهم شد که بیشتر از ۶ کلاس درس نخوانده که ستاد او در پاسخ با نشان دادن مدرک دکترا و بدون نشان دادن دیپلم، لیسانس و فوق لیسانس گفته بود او "مدرک معادل دکترا" را از روحانیت خود کسب نموده است.
حسن روحانی رئیس جمهور کنونی پس از این اعلان نتایج برای تبریک به دفتر وی رفت و متعهد شد که یک انتقال آرام قدرت داشته باشد و گفت: "ما در مدت ۴۵ روز آینده که رئیس جمهور جدید مسئولیت دولت به دست می‌گیرد کنار رئیس جمهور منتخب خواهیم بود و به طور کامل همکاری خواهیم کرد". محمد جواد ظریف وزیر امور خارجه نیز گفت که رئیسی ایران را به خوبی هدایت خواهد کرد. مقامات روسیه، چین، ونزوئلا، مالزی، ویتنام تقریبا بلافاصله یا در زمان کوتاهی پیروزی رئیسی را تبریک گفتند و کشورهای غربی از اظهار نظر در این زمینه خودداری کردند. آمریکا و اسرائیل با صدور بیانه‌های جداگانه‌ای رئیسی را متهم به عنصری در اعدام‌های اوائل انقلاب کردند.
براساس اظهارات جمال عرف آرای باطله غیر مأخوذه درون صندوق: ۱۰۰,۲۳۱ برگ؛ آرای مأخوذه: ۲۸,۶۵۰,۵۰۵ رأی؛ آرای باطله مأخوذه: ۳,۷۴۰,۶۸۸ رأی و آرای صحیح: ۲۴,۹۰۹,۸۱۷ رأی بوده، ۲۳۸,۰۰۰ هزار نفر نیز رای خود را بدون آنکه به صندوق بیاندازند به خانه‌های خود برده‌اند. ۲۸.۶ میلیون رای از ۵۹ میلیون واجد شرایط و مشارکت ۴۸ درصدی کمی بیش از انتظار تحلیلگران بود. مخالفان می‌گویند که در این میزان مشارکت تقلب شده و میزان مشارکت به گفته تلویزیونی امیرحسین اعتمادی عضو گروه فرشگرد و از مخالفان دولت، حدود ۳ درصد بوده است.
دیگر گروه‌ها، بجز گروهی اندکی از تندروها و چند حزب داخلی، فیلترهای سنگین شورای نگهبان را در حذف صدها کاندید در هر دوره از هر نوع انتخابات در ایران بشدت محکوم کرده‌اند و می‌گویند بدین شکل یک نفر (یا یک گروه) خاص از پیش برای انتخابات "انتصاب" می‌شود. در طی کارزار انتخاباتی اخیر، حیدر مصلحی وزیر سابق اطلاعات طی سخنانی در تلویزیون گفته بود که وی پیش از انتخابات چند سال پیش و با گزارش و آمار به شورای نگهبان رفته و با نشان دادن احتمال پیروزی ۷۰ درصدی هاشمی رفسنجانی سبب رای عدم صلاحیت شورای نگهبان به رفسنجانی شده بود. چند ویدئو در این باره از جمله یک ویدئو از خود رفسنجانی که این موضوع را تایید کرده‌اند، به بیرون درز کرده است و این اعلانات همراه با رد موضوع توسط سخنگوی شورای نگهبان سبب بروز اعتراضات شدید شد. فائزه، دختر رفسنجانی نیز در همین ارتباط گفت که دوران جمهوری اسلامی تمام شده و دوران حکومت اسلامی آغاز گشته و پس از انتخابات گفت که در این انتخابات رای نداده است.
علی لاریجانی، رئیس سابق مجلس نیز همراه با محمود احمدی‌نژاد از رد صلاحیت شدگان این انتخابات هستند که هر دو خواستار توضیح شورای نگهبان می‌باشند. سید حسن خمینی، نوه روح‌الله خمینی که در مشورت با خامنه‌ای از انتخابات منصرف شده بود، در طول انتخابات بشدت به حکومتی شدن آن اعتراض کرده بود.
برخی از تحلیلگران می‌گویند پیروزی رئیسی در انتخابات در جهت جانشینی او بجای خامنه‌ای‌ست. خامنه‌ای خود پیشتر با حمایت شدید رفسنجانی جایگزین روح الله خمینی در رهبریت جمهوری اسلامی شده بود.